Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms