Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps3P62908 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps3P62908 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms