Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lmo4P61969 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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