Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms