Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf1P61148 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms