Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Csrnp3P59055 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms