Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P58686 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P58686 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P58686 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P58686 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P58686 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms