Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms