Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp1P58466 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms