Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dpf3P58269 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms