Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms