Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TdgP56581 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TdgP56581 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TdgP56581 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TdgP56581 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TdgP56581 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TdgP56581 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TdgP56581 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TdgP56581 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TdgP56581 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TdgP56581 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TdgP56581 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms