Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms