Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GemP55041 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GemP55041 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GemP55041 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GemP55041 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms