Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms