Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms