Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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