Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dbx1P52950 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms