Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RorcP51450 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RorcP51450 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RorcP51450 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RorcP51450 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RorcP51450 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RorcP51450 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RorcP51450 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RorcP51450 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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RorcP51450 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RorcP51450 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RorcP51450 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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