Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MipP51180 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MipP51180 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MipP51180 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MipP51180 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MipP51180 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MipP51180 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MipP51180 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MipP51180 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MipP51180 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MipP51180 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MipP51180 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MipP51180 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MipP51180 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MipP51180 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MipP51180 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms