Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs12P50716 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms