Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt6aP50446 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt6aP50446 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt6aP50446 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt6aP50446 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt6aP50446 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt6aP50446 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt6aP50446 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt6aP50446 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt6aP50446 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt6aP50446 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt6aP50446 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt6aP50446 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt6aP50446 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms