Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms