Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms