Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms