Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms