Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms