Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl5P47962 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms