Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf1P46099 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms