Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms