Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tnfsf9P41274 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tnfsf9P41274 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tnfsf9P41274 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tnfsf9P41274 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tnfsf9P41274 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tnfsf9P41274 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tnfsf9P41274 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tnfsf9P41274 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tnfsf9P41274 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf9P41274 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tnfsf9P41274 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms