Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms