Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpargP37238 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpargP37238 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpargP37238 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms