Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms