Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5cP35278 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5cP35278 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5cP35278 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5cP35278 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5cP35278 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rab5cP35278 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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