Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pola1P33609 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pola1P33609 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pola1P33609 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms