Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rom1P32958 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rom1P32958 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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