Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
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