Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb9P28076 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms