Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afxP27661 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms