Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms