Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms