Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd247P24161 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms