Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkchP23298 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkchP23298 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms