Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P20040 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P20040 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P20040 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P20040 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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