Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms