Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd1P19182 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms