Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Defa-rs2P17534 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Defa-rs2P17534 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Defa-rs2P17534 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Defa-rs2P17534 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs2P17534 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms