Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptbP15508 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptbP15508 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptbP15508 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptbP15508 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SptbP15508 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SptbP15508 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SptbP15508 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SptbP15508 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SptbP15508 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SptbP15508 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SptbP15508 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SptbP15508 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SptbP15508 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SptbP15508 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SptbP15508 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SptbP15508 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SptbP15508 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms