Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms